Πραγματοποιήθηκε η κλήρωση για τους ομίλους του Κυπέλλου Ελλάδας 2016-17. Η ομάδα της ΑΕΛ θα αντιμετωπίσει τους: ΠΑΟΚ, Τρίκαλα και Πανελευσινιακό ή Ζάκυνθο (1ος όμιλος):
1η αγωνιστική
25, 26, 27 Οκτωβρίου:
ΠΑΟΚ - ΑΕΛ
Πανελευσινιακός ή Ζάκυνθος - Τρίκαλα
2η αγωνιστική
29, 30 Νοεμβρίου, 1 Δεκεμβρίου:
ΑΕΛ - Πανελευσινιακός ή Ζάκυνθος
Τρίκαλα - ΠΑΟΚ
3η αγωνιστική
13, 14, 15 Δεκεμβρίου:
Τρίκαλα - ΑΕΛ
Πανελευσινιακός - ΠΑΟΚ
1η αγωνιστική
25, 26, 27 Οκτωβρίου:
ΠΑΟΚ - ΑΕΛ
Πανελευσινιακός ή Ζάκυνθος - Τρίκαλα
2η αγωνιστική
29, 30 Νοεμβρίου, 1 Δεκεμβρίου:
ΑΕΛ - Πανελευσινιακός ή Ζάκυνθος
Τρίκαλα - ΠΑΟΚ
3η αγωνιστική
13, 14, 15 Δεκεμβρίου:
Τρίκαλα - ΑΕΛ
Πανελευσινιακός - ΠΑΟΚ